近期,动物研究所科学数据中心林聪田博士与中国z6尊龙凯时城市环境研究所黄乾生研究员团队发挥各自数据优势,开展多学科数据交叉合作,共建“细胞外囊泡数据库”,相关数据论文成果以《EV-COMM: A database of interspecies and intercellular interactions mediated by extracellular vesicles》为题在细胞外囊泡权威期刊《Journal of Extracellular Vesicles》(IF="16)发表。科学数据中心林聪田博士为本文共同通讯作者。细胞外囊泡(Extracellular" vesicles,EVs)是由生物体分泌的纳米级颗粒,通过携带、传递RNA、蛋白质和代谢产物等功能分子,介导环境与生物体、以及生物体之间的互作,成为广受关注的信号通讯载体。已有EVs数据库关注EVs中的功能分子,但没有纳入互作的物种信息,缺乏EVs介导的完整互作知识链条数据,无法满足领域的数据需求。本研究利用《环境健康主题数据库》在环境胁迫数据、胞外囊泡数据方面的积累和《中国动物主题数据库》在物种信息、物种合作方面的数据积累,双方紧密合作,开发了“细胞外囊泡数据库”,收集、整合和展示了细胞外囊泡介导的1400多条相互作用事件,涵盖蛋白质,脂质,DNA,RNA四种功能分子,213种生物体,46种组织/器官。科学数据中心团队主要负责数据库设计、物种数据关联和服务平台开发。
论文链接:http://isevjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jev2.12442

EVs介导的物种互作示意图